گروه شیلات، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه ارومیه، ارومیه، ایران
چکیده: (64 مشاهده)
زندگی انسان و میکروارگانیسمها به هم گره‌خورده است و بسیاری از این میکروارگانیسمها برای انسان سودمند میباشند. باکتریهای نمک‌دوست (هالوفیل) قادر به تولید آنزیم‌هایی هستند که در شرایط پرشور، دمای بالا یاPHغیرعادی فعال باقی می‌مانند. این آنزیم‌ها در صنایع غذایی، دارویی، نساجی، شوینده‌ها و زیست‌فناوری کاربرد دارند. لذاشناسایی میکروارگانیسم‌هایی که در محیط‌های پرشوری مانند دریاچه ارومیه با شوری بسیار بالا زنده می‌مانند، امکان طراحی بیورآکتورهایی با شرایط مشابه را فراهم می‌کند. در این مطالعه بررسی تنوع باکتریهای نمک دوست دریاچه ارومیه با استفاده از تکنیک PCR-DGGE انجام شد. به همین منظور نمونه آب و نمک دریاچه از شش ناحیه مختلف دریاچه ارومیه برداشت شد. باکتریهای موجود در آب دریاچه مستقیماً پس از تخلیص توسط سانتریفیوژ با دور بالا جهت استخراج DNA بکار رفتند. DNA حاصل سپس در تکنیک PCR با استفاده از یک جفت پرایمر یونیورسال به‌صورت اختصاصی تکثیر شد. قطعات حاصل سپس در تکنیک الکتروفورز DGGE موردبررسی قرار گرفتند. باندهای حاصل سپس توسط کیت Roche از درون ژل استخراج شدند، مجدداً توسط PCR تکثیر شدند و محصول PCR حاصل توالی یابی شدند. بررسی تنوع نوکلئوتیدی توسط نرم‌افزار انجام شد و مقایسه آن‌ها در بانک ژنی توانست گونه و جنس این باکتریها را شناسایی نماید. این بررسی ضمن اثبات قابلیت و توانایی تکنیک DGGE برای بررسی تنوع باکتریهای یک محیط توانست چند گونه و جنس جدید باکتری نمک دوست جدید در داخل دریاچه ارومیه شناسایی نماید که قبلاً توسط تکنیک‌های مرسوم کشت غیرقابل‌شناسایی بودند. در این تحقیق گونه جدیدی از باکتریهای نمک دوست با عنوان Deefgea rivuliدر دریاچه ارومیه شناسایی شد که پیش‌ازاین در چنین محیط فوق اشباعی گزارش نشده بود.
Manaffar R, Geravandi F. Investigation of Halophilic Bacterial Diversity in Lake Urmia Using PCR-DGGE Technique. Journal title 2025; 1 (1) :27-34 URL: http://injbr.com/article-1-22-fa.html
مناف فر رامین، گراوندی فاطمه. بررسی تنوع باکتریهای نمک دوست دریاچه ارومیه با استفاده از تکنیک PCR-DGGE. عنوان نشریه. 1404; 1 (1) :27-34
